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すべてのプログラミングをペアで行うべきかどうかには、意見が分かれる。Jim Coplienはプログラミング作業だけでなくリスクが大きい作業や逆にクリエイティブな作業はペアで行ったほうが効果的としており、Pairwise Workという言葉を使っている。また、ペアプログラミングの研究はLaurie Williamsが大きく貢献しており、書籍『ペアプログラミング』にさまざまな組み合わせ（初心者と上級者のマトリクス）が上げられている。
